2024年7月8日下午,生命科学学院生命科学前沿论坛特邀请中国科学院动物研究所的赵方庆研究员作题为“生物大数据挖掘技术及应用”的精彩报告,本次报告赵研副教授主持。
生命大数据在生命科学领域愈发重要,但如何在高纬、多噪的数据中去挖掘和解析有效数据,并利用这些数据服务于基础研究和医学应用仍面临巨大挑战。在此背景下,赵方庆团队工作一直致力于建立和开发更高效的分析统计模型和数据挖掘算法。
在报告会上,赵方庆教授先后分享了课题组近些年在肠道菌群与健康、环形非编码搁狈础及单细胞及空间多组学技术叁个研究方向上的技术创新、统计模型建立和算法工具开发优化。主要包括他们先后开发的基于互作网络的菌群标志物识别算法的多种肠道菌群结构及功能的精准解析技术,结合滚动循环逆转录和纳米孔测序及开发的颁滨搁滨-濒辞苍驳、颁滨搁滨-诲别别辫和CIRIquant算法的高效测定环形搁狈础识别、定量和可变剪接体检测与定量等技术,及基于新开发的胞外小囊泡异质性追踪算法SEVtras实现在单细胞数据中高效识别胞外小囊泡并准确测量其分泌活性的技术。相关技术在解析菌群互作与母婴健康、应急病原体检测、肿瘤早期生物标志物检测等人类健康和疾病领域相关机制具有重要意义。
报告结束后,在交流讨论环节师生们就生物信息学方法和技术在细胞外囊泡数据挖掘及叁维空间中的表达检测、纳米孔糖测序、可变剪接体识别、微生物分子生态等研究方面的应用进行了请教,赵方庆教授对上述问题进行了详细解答。这场精彩的学术报告在师生们的热烈掌声中结束。