2024年4月3日,生命科学学院邀请中国农业大学的宋文教授带来了题为“植物抗病蛋白激活免疫的分子机制”的精彩报告,报告在教一楼105进行,由周冕教授主持。
在植物和动物免疫过程中,宿主通过细胞死亡限制病原菌的入侵。这一过程依赖于免疫相关的NLR类蛋白(含有核苷酸结合结构域及富含亮氨酸重复序列的受体)在识别病原菌效应子后的构象变化。但与动物免疫不同,植物中NLR蛋白可以分为CC-NLR和TIR-NLR。其中CC-NLR在之前的报道中能够识别效应子,形成抗病小体并在细胞膜上组成钙离子通道,触发钙离子信号介导的细胞程序性死亡。而TIR-NLR蛋白作为仅在双子叶植物中发现的NLR蛋白,其抗病机制研究相对较少,其功能和意义也不是很清楚。
在已有的报道中动物的部分TIR-NLR具有NAD+水解酶活性,宋文教授通过序列比对和功能分析发现在植物中大部分TIR-NLR的TIR结构域都具有NAD+水解酶活性的功能序列,并利用结构生物学和生物化学的方法,证明植物中的TIR结构域通过组装成四聚体形式获得NAD+水解全酶活性。为了进一步明确TIR结构域具有NAD+水解酶活性的意义,宋文教授利用烟草体系中进行实验探究,结果证明TIR结构域水解NAD+的产物对于免疫激活发挥重要作用,进一步通过质谱分析宋文教授初步筛选出TIR结构域水解NAD+的小分子产物,但在后续实验发现这些小分子产物不能发挥有效作用。通过文献查阅发现,在ETI免疫过程中,多种NLR蛋白识别效应子后会将信号传递至TIR-NLR蛋白EDS1(ETI途径免疫信号的枢纽),EDS1接受信号后通过构象变化与SAG101和PAD4发生互作并分别触发下游植物免疫和细胞凋亡,但EDS1与SAG101和PAD4互作的机制尚不明确。
宋文教授通过昆虫体系重组了EDS1与SAG101和PAD4并通过结构生物学、高分辨率质谱以及生物化学的方法发现,EDS1与SAG101和PAD4的互作分别依赖ADPr-ATP/di-ADPR和pRib-AMP/ADP,而这两种物质正是TIR结构域水解NAD+的小分子产物的两种组装产物,这也解释了为何在前期研究中小分子产物不能发挥有效作用。以上研究表明TIR-NLR识别效应子后能够通过构象变化激活NAD+水解全酶活性水解NAD+,并通过水解产物传递免疫信号,触发下游免疫过程,调控细胞凋亡。
在植物体内还存在一类非典型的TIR-NLR蛋白,它仅含有TIR结构域,但仍能在免疫过程中发挥作用。这表明TIR结构域的激活不仅仅依赖于效应子的识别,还依赖其他未知的方式。宋文教授通过体外纯化TIR结构域,发现TIR结构域蛋白能够响应NAD+/ATP在体外快速形成凝聚体,通过分子化学和遗传学的方法探究,发现凝聚体形式有助于TIR结构域蛋白形成四聚体形式并发挥NAD+水解酶活性。而在烟草和拟南芥中凝聚体形式的TIR结构域蛋白也会导致细胞凋亡。通过结构生物学的方法,宋文教授发现NAD+能够引起TIR结构域中名为BB-LOOP的低复杂区域的构象变化,促进TIR结构域头尾相连,有助于形成四聚体。同时也发现关键氨基酸的突变会破坏NAD+与TIR结构域的结合,影响聚集体形成,干扰NAD+水解活性的激活。有趣的是,宋文教授在研究过程意外发现TIR-NLR蛋白具有核酸酶活性,能够与双链RNA或DNA结合并促进水解,在这个过程中的产物是2’,3’-肠础惭笔而不是经典的第二信使3’,5’-肠础惭笔。2’,3’-肠础惭笔能够作为信号促进下游免疫过程。
宋文教授的讲述逻辑清晰、深入浅出、内容丰富,既总结了自己十年来的研究成果,也带大家感受到了结构生物学的魅力,引起现场师生的强烈掌声。报告结束后,与会师生踊跃提问,宋文教授耐心解答,双方深入交流、共同探讨。
报告人介绍:宋文教授2018年博士毕业于清华大学, 2018年-2023年在德国马克斯-普朗克研究所和科隆大学从事博士后研究。2023年以“杰出人才”引进中国农业大学,任生物学院教授、植物抗逆高效全国重点实验室课题组长。宋文教授重点关注植物与微生物、植物与环境的互作,主要以生物化学、结构生物学和遗传学为手段,探究植物受体介导的免疫反应和非生物胁迫应答的分子机制;同时也关注植物小分子、小肽激素参与的生长发育及免疫胁迫应答机制。近年来,宋文教授在植物免疫和小肽激素领域取得了一系列原创性研究成果,以(共同)第一作者/通讯作者在Nature, Science, Cell, Cell Research,Nature Plants, Nature Structural & Molecular Biology, Molecular Plant, Nature Communications等国际学术期刊上发表论文二十余篇。