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91糖心vlog传媒- 师资队伍- 专任教师- 进化与生态学系

进化与生态学系

孙成

教授，博士生导师

  • 联系方式

    邮箱：肠丑别苍驳.蝉耻苍蔼肠苍耻.别诲耻.肠苍

  • 招生方向

    硕士研究生招生：生物信息学（不区分研究方向）、生态学（04生态基因组学）、动物学（06进化与功能基因组学）
    博士研究生招生：生物信息学（不区分研究方向）、生态学（02生态基因组学）

91糖心vlog传媒

教育及工作经历：

2022至今 91糖心vlog传媒生命科学学院 教授/研究员 博士生导师

2015至2022 中国农业科学院蜜蜂研究所 研究员 博士生导师

2011至2015 美国Colorado State University 博士后

2009至2010 美国University of Texas at Arlington 博士后

2004至2009 中国科学院遗传与发育生物学研究所 博士研究生


研究领域：

本实验室从事基因组学与生物信息学研究，主要以蜜蜂科熊蜂属的昆虫为研究对象，采用基因组学、生物信息学、以及分子生物学方法：

1、研究基因组演化、表型多样化以及物种分化的分子机制，尤其是转座子等重复序列在这些过程中的作用。

2、探究熊蜂社会分工行为的演化，聚焦社会性寄生行为产生的遗传基础。

3、理解熊蜂环境适应性的遗传基础及分子机制；采用保护基因组学方法监测熊蜂的种群动态、鉴定出威胁熊蜂种群的环境因子，致力于野生熊蜂的保护。

4、挖掘与熊蜂繁殖、耐逆、授粉性能相关的基因，并利用这些基因培育具有优良品质的国产蜂种，服务于设施农业生产。

5、完成上述研究内容所需的生物信息学工具开发与流程搭建。


代表性成果（*通讯作者；#第一作者）：

  1. Sang H, Li Y, Tan S, Gao P, Wang B, Guo S, Luo S, Sun C*. 2024. Conservation genomics analysis reveals recent population decline and possible causes in bumblebee Bombus opulentus. Insect Science. Jan 31. doi: 10.1111/1744-7917.13324. [中科院1区]

  2. Li Y, Yao J, Sang H, Wang Q, Su L, Zhao X, Xia Z, Wang F, Wang K, Lou D, Wang G, Waterhouse RM, Wang H, Luo S, Sun C*. 2024. Pan-genome analysis highlights the role of structural variation in the evolution and environmental adaptation of Asian honeybees. Molecular Ecology Resources. 24(2):e13905. [中科院1区]

  3. Namasivayam S#, Sun C#, Bah AB, Oberstaller J, Pierre-Louis E, Etheridge RD, Feschotte C, Pritham EJ, Kissinger JC. 2023. Massive invasion of organellar DNA drives nuclear genome evolution in Toxoplasma. Proc Natl Acad Sci USA. 120(45):e2308569120. [中科院1区]

  4. Sun C*, Zhang A, Chen J, Schaack S. 2023. 'Junk' that matters: the role of transposable elements in bumblebee genome evolution. Current Opinion in Insect Science. 59:101103. [中科院1区]

  5. Cao L, Zhao X, Chen Y, Sun C*. 2021. Chromosome-scale genome assembly of the high royal jelly-producing honeybees. Scientific Data. 8: 302.

该研究成果被评为“2021浙江科技大事件”

  1. Ding L, Sang H, Sun C*. 2021. Genus-wide characterization of nuclear mitochondrial DNAs in bumblebee (Hymenoptera: Apidae) genomes. Insects. 12(11):963.

  2. Sun C*, Huang J, Wang Y, Zhao X, Su L, Thomas GWC, Zhao M et al. 2021. Genus-wide characterization of bumblebee genomes provides insights into their evolution and variation in ecological and behavioral traits. Molecular Biology and Evolution. 38(2):486-501. [中科院1区]

Highlighted by Nature Reviews Genetics (doi:10.1038/s41576-020-00294-9)

  1. Zhao X, Su L, Xu W, Schaack S, Sun C*. 2020. Genome-wide identification of accessible chromatin regions in bumblebee by ATAC-seq. Scientific Data. 7: 367.

  2. Zhao X, Su L, Schaack S, Sadd BM, Sun C*. 2018. Tandem repeats contribute to coding sequence variation in bumblebees (Hymenoptera: Apidae). Genome Biology and Evolution. 10(12):3176–3187.

  3. Sun C, Feschotte C, Wu Z, Mueller RL. 2015. DNA transposons have colonized the genome of the giant virus Pandoravirus salinus. BMC Biology. 13(1): 38. [中科院1区]

  4. Sun C, Mueller RL. 2014. Hellbender genome sequences shed light on genomic expansion at the base of crown salamanders. Genome Biology and Evolution. 6(7): 1818-1829.

  5. Sun C, Wyngaard G, Walton DB, Wichman HA, Mueller RL. 2014. Billions of basepairs of recently expanded, repetitive sequences are eliminated from the somatic genome during copepod development. BMC Genomics. 15(1): 186.

  6. Sun C, López Arriaza JR, Mueller RL. 2012. Slow DNA loss in the gigantic genomes of salamanders. Genome Biology and Evolution. 4(12): 1340-1348.

Recommended by F1000（http://f1000.com/prime/718020336)

  1. Sun C, Shepard DB, Chong RA, López Arriaza J, Hall K, Castoe TA, Feschotte C, Pollock DD, Mueller RL. 2012. ?LTR retrotransposons contribute to genomic gigantism in plethodontid salamanders. Genome Biology and Evolution. 4(2): 168–183.


社会服务工作：

中国昆虫学会青年工作委员会委员

第叁次全国畜禽遗传资源普查技术专家组成员

中国科学、Molecular Ecology, Genome Biology and Evolution等杂志审稿人


执教课程：

《生物信息学》、《生态学》